Two sequential outbreaks caused by multidrug-resistant Acinetobacter baumannii isolates producing OXA-58 or OXA-72 oxacillinase in an intensive care unit in France

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Diversité agro-morphologique des accessions de fonio [Digitaria exilis (Kippist.) Stapf.] au Niger

La variablité morphologique de 67 accessions de fonio [Digitaria exilis (Kippist.) Stapf.] collectées au Niger a été évaluée au cours de deux  années (2011 et 2012). Seize (16) caractères agro morphologiques (dont 14 caractères quantitatifs et 2 caractères qualitatifs) ont été évalués en station dans deux zones agroécologiques différentes (Tarna en zone sahélo-saharienne et Tara en zone soudanienne). La classification  acsendante hierarchique (CAH) et l’analyse factorielle discriminante (AFD) ont mis en évidence quatre groupes (GI, GII, GIII et GIV). Les accessions du groupe GIV ont en moyenne un cycle de maturité compris entre 85 et 90 jours tandis que les autres groupes présentent un cycle de maturité superieur à 90 jours dans nos conditions expérimentales. Les résultats montrent que les variables les plus discriminantes qui permettent de  décrire la variabilité entre les groupes identifiés sont la biomasse sèche (tige et feuille) par hectare, la longueur des entrenoeuds, le rendement en graine par hectare et dans une certaine mesure le cycle de la plante. L’observation des caractères qualitatifs a montré que cinq accessions (représentant 7% du total) ont des graines non decortiquées de couleur rouge et quatre accessions (6% du total), une tige de couleur rouge. Les caractères analysés peuvent ainsi constituer des critères de base pour différencier les accessions des autres régions de l’Afrique de l’Ouest et servir pour une étude de variabilité entre les restes des accessions de fonio collectées au Niger. Des possiblités d’amélioration peuvent  également être envisagées une fois que le regime de réproduction de l’espèce est bien identifié.Mots clés: Digitaria exilis, variabilité morphologique, accessions, diversité, fonio, Niger

Analyse multiéchelle de la diversité génétique des sorghos : compréhension des processus évolutifs pour la conservation in situ

Using microsatellite genetic markers, we analyzed 1,518 sorghum samples collected at different spatial scales in Burkina Faso, Mali, Niger, and in the village of Wanté, from the landrace to the country scale. Genetic diversity and differentiation parameters were estimated to assess the effects of the main evolutionary processes on sorghum genetic diversity. The genetic variability found within a variety is mainly the result of the sorghum reproduction biology and the genetic drift process caused by the limited number of reproductive individuals at the time of variety introduction into a household or each year when farmers select their seeds. At the village scale, a low correlation is observed between the diversity of vernacular names and the genetic diversity assessed by microsatellites. No spatial genetic structuration is observed among villages more than 30 kilometers apart. This point highlights that traditional seed systems operate at a very local scale. In Mali, a similar proportion of allelic richness is observed along a longitudinal transect and a latitudinal gradient that crosses a larger range of agroclimatic conditions. At the country scale, sorghum exhibits more genetic diversity in Niger than in Mali despite a lower agroclimatic range in Niger. These results demonstrate that the diversity of human groups acts together with the agro-ecological factors to shape the structure of sorghum genetic diversity. An important proportion of the overall genetic diversity present in the Cirad (Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement) "core collection" is found in Mali and Niger. The tremendous diversity cultivated by farmers in traditional agroecosystems of Western Africa supports the relevance of in situ approaches for sorghum conservation programs in this region. Both conservation and crop improvement requirements can be achieved through a better use of local germplasm in decentralized breeding programs. (Summary in English)

New Disturbing Trend in Antimicrobial Resistance of Gram-Negative Pathogens

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